细胞系鉴定的重要性
1.NIH、ATCC、Nature 和 Science 等近年对此多次发出呼吁,要求研究学者对细胞进行鉴定。短串联重复序列 (Short tandem repeat, STR) 分析可以帮助研究人员确认细胞株的身份,以及它是否不受其他细胞株和微生物的污染。据统计,15-20% 的细胞培养存在交叉污染或错误识别,导致时间、金钱以及由于数据无效致使文章退稿。NIH 建议,所有细胞系在发表前都要经过认证;Nature 杂志要求,发布新的人类胚胎干细胞株的论文前需要提供 STR 鉴定报告。
2. 保证细胞一致性,可靠性:FDA 建议研究人员在培养细胞的较早阶段(细胞培养第一周)鉴定细胞系的身份。细胞在被冻存前应再一次 进行鉴定;对于生长活跃的细胞,应每两个月鉴定一次;文献发表前也应对细胞系身份进行鉴定。如果一个实验室使用不止一种细胞系, 则应在实验最开始时,就要对所有的细胞系进行鉴定,以便排除交叉污染的可能。
3. 为新建细胞系建立「身份证明」:2015 新版药典中,规定新建细胞系/株、细胞库(MCB、WCB)和生产的终末细胞均应进行鉴别实 验,以确认为本细胞,且无其他细胞的交叉污染。(——《生物制品生产检定用动物细胞基质制备及鉴定规程》)
细胞系鉴定与 STR 的关系
STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列)基因分型已被 CLAC、ATCC 等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。
STR 基因位点由长度为 3-7 个碱基对的短串连重复序列组成,这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细 胞的 DNA 指纹,其可通过 PCR(聚合酶式反应)来检测,STR 基因位点上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分, 在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法,即可根据所得的 STR 分型结果与专业的细胞 STR 数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系。
1.NIH、ATCC、Nature 和 Science 等近年对此多次发出呼吁,要求研究学者对细胞进行鉴定。短串联重复序列 (Short tandem repeat, STR) 分析可以帮助研究人员确认细胞株的身份,以及它是否不受其他细胞株和微生物的污染。据统计,15-20% 的细胞培养存在交叉污染或错误识别,导致时间、金钱以及由于数据无效致使文章退稿。NIH 建议,所有细胞系在发表前都要经过认证;Nature 杂志要求,发布新的人类胚胎干细胞株的论文前需要提供 STR 鉴定报告。
2. 保证细胞一致性,可靠性:FDA 建议研究人员在培养细胞的较早阶段(细胞培养第一周)鉴定细胞系的身份。细胞在被冻存前应再一次 进行鉴定;对于生长活跃的细胞,应每两个月鉴定一次;文献发表前也应对细胞系身份进行鉴定。如果一个实验室使用不止一种细胞系, 则应在实验最开始时,就要对所有的细胞系进行鉴定,以便排除交叉污染的可能。
3. 为新建细胞系建立「身份证明」:2015 新版药典中,规定新建细胞系/株、细胞库(MCB、WCB)和生产的终末细胞均应进行鉴别实 验,以确认为本细胞,且无其他细胞的交叉污染。(——《生物制品生产检定用动物细胞基质制备及鉴定规程》)
细胞系鉴定与 STR 的关系
STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列)基因分型已被 CLAC、ATCC 等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。
STR 基因位点由长度为 3-7 个碱基对的短串连重复序列组成,这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细 胞的 DNA 指纹,其可通过 PCR(聚合酶式反应)来检测,STR 基因位点上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分, 在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法,即可根据所得的 STR 分型结果与专业的细胞 STR 数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系。