发文章细胞株鉴定发现被Hela污染,血泪教训!
点击量:发布时间:2019-01-02 21:23:55文章来源:未知
说起细胞株鉴定,本人有些过来人的经验,中间也因此吃了不少苦头,借此机会和大家分享,也希望大家引以为戒,避免重蹈覆辙。
上海某985高校的硕博连读生,研究生方向是肿瘤间质细胞及微环境调控。在实验室的前三年,实验顺风顺水,都按老板的设计要求一步一步完成,结果还不错,也基本验证了最初的假设。老板说发个Cancer Res问题不大,偶心想毕业应该有保障了。于是着手写文章,一个月成稿,交老板审阅修改,16年7月3号投到Cancer Res,审稿40天后意见返回,两个reviewer,意见都算positive,但需要补充一个目的基因的沉默实验,要求三个月内提交。同时两个reviewer均提出了要对所用细胞进行细胞株鉴定(Cell Line Authentication)的要求。实验中我们用了三株肝癌细胞:HCC827、HepG2和Hep3B,都是师姐们传下来的。
于是下来接着补实验,但细胞鉴定我们自己做不了,只能找有资质的机构做了。搜索园里的信息,发现最权威的细胞鉴定应该是ATCC了,发邮件联系了一下,费用是195$一株,快递过去光路上就要1-2周时间,细胞估计早就**降解了,并且要用Master或者Visa卡付款,必须是美金。老板说美果仁的receipt报销也是问题,只能在国内找家机构检测。问了隔壁实验室的同学,他们都是在一个生物公司做的。联系上这家公司以后,直接按公司要求快递三株细胞悬液过去,速度是快,第三天发来了PDF版本的英文鉴定报告。看到报告当时直接蒙圈.....HCC827和Hep3B都没问题,但HepG2竟然是Hela!!!和老板商量下来,只能面对现实。但实验如果全部重做,时间来不及,毕业估计都成问题。还好老板慈悲,要求把所有涉及HepG2的实验数据直接剔除,改投Int J Cancer,同时向Cancer Res编辑部写信,说明由于细胞原因,我们决定撤稿。
2016年12月8号把后面补充的实验数据加上去,改投了Int J Cancer,这个杂志也要求对所用细胞进行Authentication,所以投稿时直接把苏州鉴达的细胞株鉴定英文报告一起上传了。这次还算顺利,审稿28天,直接给小修,要求语言润色。老板找了几个学校的大牛改了改,两周后提交,当天直接接受!
本来是篇Cancer Res,现在变成Int J Cancer,血泪教训。前段时间老板要求实验室所有细胞要进行细胞鉴定,并安排专人管理实验室的细胞株。20株细胞中有6株有问题,一半属于标注错误,A细胞标成B细胞,一半是hela污染。
国内细胞污染中,90%都是hela(原来hela如此强大)!所以想借我的经验提醒大家,实验之前必须要做个细胞鉴定,否则追悔莫及!现在很多杂志都要求投稿时附上细胞株鉴定的报告,我想也是对我们自己实验结果负责。
近期急着写大论文,马上要毕业了,祝还在园子里逛的师弟师妹们实验顺利!
上海某985高校的硕博连读生,研究生方向是肿瘤间质细胞及微环境调控。在实验室的前三年,实验顺风顺水,都按老板的设计要求一步一步完成,结果还不错,也基本验证了最初的假设。老板说发个Cancer Res问题不大,偶心想毕业应该有保障了。于是着手写文章,一个月成稿,交老板审阅修改,16年7月3号投到Cancer Res,审稿40天后意见返回,两个reviewer,意见都算positive,但需要补充一个目的基因的沉默实验,要求三个月内提交。同时两个reviewer均提出了要对所用细胞进行细胞株鉴定(Cell Line Authentication)的要求。实验中我们用了三株肝癌细胞:HCC827、HepG2和Hep3B,都是师姐们传下来的。
于是下来接着补实验,但细胞鉴定我们自己做不了,只能找有资质的机构做了。搜索园里的信息,发现最权威的细胞鉴定应该是ATCC了,发邮件联系了一下,费用是195$一株,快递过去光路上就要1-2周时间,细胞估计早就**降解了,并且要用Master或者Visa卡付款,必须是美金。老板说美果仁的receipt报销也是问题,只能在国内找家机构检测。问了隔壁实验室的同学,他们都是在一个生物公司做的。联系上这家公司以后,直接按公司要求快递三株细胞悬液过去,速度是快,第三天发来了PDF版本的英文鉴定报告。看到报告当时直接蒙圈.....HCC827和Hep3B都没问题,但HepG2竟然是Hela!!!和老板商量下来,只能面对现实。但实验如果全部重做,时间来不及,毕业估计都成问题。还好老板慈悲,要求把所有涉及HepG2的实验数据直接剔除,改投Int J Cancer,同时向Cancer Res编辑部写信,说明由于细胞原因,我们决定撤稿。
2016年12月8号把后面补充的实验数据加上去,改投了Int J Cancer,这个杂志也要求对所用细胞进行Authentication,所以投稿时直接把苏州鉴达的细胞株鉴定英文报告一起上传了。这次还算顺利,审稿28天,直接给小修,要求语言润色。老板找了几个学校的大牛改了改,两周后提交,当天直接接受!
本来是篇Cancer Res,现在变成Int J Cancer,血泪教训。前段时间老板要求实验室所有细胞要进行细胞鉴定,并安排专人管理实验室的细胞株。20株细胞中有6株有问题,一半属于标注错误,A细胞标成B细胞,一半是hela污染。
国内细胞污染中,90%都是hela(原来hela如此强大)!所以想借我的经验提醒大家,实验之前必须要做个细胞鉴定,否则追悔莫及!现在很多杂志都要求投稿时附上细胞株鉴定的报告,我想也是对我们自己实验结果负责。
近期急着写大论文,马上要毕业了,祝还在园子里逛的师弟师妹们实验顺利!
上一篇:没有了